在農業發展過程中，病蟲害是影響農作物產量和農業發展一個重要影響因素。病蟲害的發生會影響農作物的生長，造成農作物質量和產量的下降，給農業生產帶來巨大的損失。病蟲害的發生和氣象變化有著非常密切的聯系，農業氣象站的建設不僅僅可以用來防范農業氣象災害，還可以用來防范病蟲害的發生。

有句話叫做“旱生蟲，濕生病”，氣象的變化是病蟲害發生的關鍵因素之一，溫度、濕度、風速、風向、降雨等氣象要素都會影響到害蟲的繁殖、發育和遷徙以及病害的擴散。而農業氣象站可以對農田環境中的氣象要素進行不間斷的監測，用戶可以根據氣象信息的變化來預估病蟲害發生的時機，提前做好病蟲害的防治工作。

蚜蟲是農業生產中常見的最常見的害蟲之一，蚜蟲會吸收植物的汁液，影響作物的生長，還會造成植物形成蟲癭，造成花、葉、芽的畸形。溫度和降水是影響蚜蟲危害程度的主要氣象因素，高溫、干燥的天氣會加劇蚜蟲的擴散。另一種常見的害蟲玉米螟就喜歡高溫高濕的環境。此外風速風向會有利于害蟲的遷徙，在有風天氣害蟲會借助氣流起飛進行遷徙。作物的病害同樣會借助風進行傳播，一些真菌疾病的致病孢子會通過氣流傳播，造成病情的擴散。早高溫高濕的環境或者是光照不足的環境有利于作物病害的流行。

病蟲害的治理不僅僅是在發生時進行治療，提前防治更是治理病蟲害的重要手段。通過農業氣象站的使用，根據氣象條件在適宜病蟲害的發生的氣象環境中及時的采取治理措施，有利于有效的控制病蟲害的發生，減輕病蟲害發生的規模，從而保證農作物的產量和質量。